一、原始凭证的税收风险
原始凭证是会计核算的基础和起点，是账户的原始基础。除发票外，还包括一些收据和专用票据。
会计在收到原始凭证后，首先要检查原始凭证是否真实，尤其是票据种类，目前纳税义务对虚假票据的检查非常严格，会计应坚决杜绝虚假票据。
然后检查发票中填写的内容是否合格，例如清晰，标准，单位名称是否标准，项目是否确实在进行，金额是否准确。
较后，检查凭证的完整性。是否可以填写所有内容都可以，也不应有遗漏。例如，是否填写了专用发票项目，是否填写了普通发票的纳税人识别号等。
二、纳税人少缴税款的税收风险
纳税人在申报过程中，不按照规定申报，明明自己不适合零申报，也要违规进行零申报，企业有未开票收入，也不按照申报的规定。办理增值税抵扣备案的纳税人应缴税额为零，也不意味着可以零申报，但应根据事实向税务机关申报。
会计交税申报时，除了申报增值税外，别忘了一些小税的申报，例如地税，印花税，土地使用税，消费税等。忽略这些小额税收很容易给企业带来税收风险。根据税收征收管理法第52条，纳税人或扣缴义务人因计算错误或其他错误而未能缴纳或少付税款的，税务机关可以追缴三元以下的税款或逾期罚款。在特殊情况下，追征期可以延长到五年。
三、纳税人错误纳税的税收风险
会计界对某些税收优惠政策的理解不彻底或存在误解，导致本应不享受税收优惠政策的企业也享受税收优惠政策。例如当月销售额在10万元以下，应免征增值税，小规模适用和一般纳税人都适用，这种理解是错误的，应该是当月销售额在10万元以下，而季度销售额(不超过30万元)则免征增值税。增值税，仅适用于增值税的小规模纳税人(包括个体工商户和其他个人等)。
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